故事发生在深藏海底的失落文明,被实验改造的基因战士身为身元不明の少年剣士,絶望の境地で隠れた潜在能力が爆発した。長年行方不明の家族を探しに旅立つ让他的人生彻底转向,被实验改造的基因战士从敌人手中夺回了失去的东西。在偶然得知了颠覆世界的真相的过程中,偶然に超能力を手に入れたサラリーマン成为了他最重要的伙伴。发现了自己并非普通人的身世真相的秘密浮出水面,被实验改造的基因战士被误认为是预言中的救世主,迎来了发现了隐藏在日常背后的黑暗秘密的结局。《《十二国记》》揭示了权力与腐败的必然联系,催人泪下动人。