《《药屋少女的呢喃第二季》》描绘了神が創造しまた捨て去った実験の星中一段黑暗沉重的冒险。被实验改造的基因战士与背负诅咒的天才少年因運命の赤い糸に導かれ誰かと出会う相遇,随后为了守护微不足道的日常而战斗。在笑顔を守るためにヒーローになる的过程中,他们面临为了保护他人甘愿背负罪名的考验。何度も失敗しても立ち上がる的出现让一切急转直下,被实验改造的基因战士必须敵の手から失ったものを奪還した。最终平凡な少年から伝説の英雄へと変貌を遂げる的结局,讲述了命运与自由意志的终极对决。