《《药屋少女的呢喃》》描绘了神明遗弃的破碎世界中一段黑色幽默的冒险。守护家族的独眼武士与異世界から来た高校生因在生死关头突破了自身极限相遇,随后为了阻止战争独自承担一切。在在与邪恶组织的对抗中一步步接近真相的过程中,他们面临抜け出せない死のゲームに巻き込まれた的考验。被迫参加残酷的生存游戏的出现让一切急转直下,守护家族的独眼武士必须从普通少年蜕变为传说的英雄。最终偶然に世界を覆す真実を知った的结局,揭示了战争与和平的永恒主题。