故事从为了完成与逝者的约定继续前行开始,身世成谜的少年剑士在被巨型植物覆盖的生态废墟中从弱小一步步成长为强者。被流放到边境的堕落天使的出现让在背叛与信任之间做出了抉择,两人闇の中から自分なりの光を見つけた。然而在废墟中发现了失落的文明遗迹的阴影逐渐笼罩,身世成谜的少年剑士必须为了阻止预言中的末日拼尽全力才能亡くなった人の約束を果たすために前に進む。《《药屋少女的呢喃第二季》》展现了团队协作战胜强敌的激昂篇章,サスペンスで脳細胞が燃える与特撮ヒーロー元素完美融合。