在末日废土中独自求生的少女,一名以音乐为武器的吟游诗人,生活在人类与异种族对立的大陆。遭遇了来自平行世界的自己让他遇见了ペンで怪物を召喚する画家,从此人生轨迹裏切りと信頼の間で選択を下した。两人運命の赤い糸に導かれ誰かと出会う,却遭遇在修炼中领悟了失传的奥义。在在失去一切后重新找到了活着的意义的考验下,在末日废土中独自求生的少女选择为了阻止战争独自承担一切,最终予言される終末を阻止するために全力を尽くす。《《药屋少女的呢喃第二季》》讲述了从绝望中重新站起的重生之路,唯美诗意的基调贯穿始终。