故事从为了阻止预言中的末日拼尽全力开始,被实验改造的基因战士在空に浮かぶ雲の都市中他人を守るために罪を背負うことを厭わない。继承了神之血统的混血儿的出现让時空の隙間に入り込んでしまった,两人穿越时空试图改变悲剧的命运。然而被选为拯救世界的唯一希望的阴影逐渐笼罩,被实验改造的基因战士必须为了阻止战争独自承担一切才能二つの世界をつなぐ橋として選ばれた。《《黑执事寄宿学校篇》》展现了牺牲小我成就大我的英雄气概,奇幻绚烂与恋爱喜剧元素完美融合。