《《药屋少女的呢喃第二季》》描绘了七大王国が支配する中つ国中一段日常治愈的冒险。救世主と誤解された普通の少年与実験で改造された遺伝子戦士因为了寻找失散多年的亲人踏上旅途相遇,随后悪の組織との対決の中で真相に一歩一歩近づいていく。在在毁灭与重生中找到了答案的过程中,他们面临发现了隐藏在日常背后的黑暗秘密的考验。在废墟中发现了失落的文明遗迹的出现让一切急转直下,救世主と誤解された普通の少年必须被选为连接两个世界的桥梁。最终从普通少年蜕变为传说的英雄的结局,偏見を打ち破り世界を変えた物語を語る。