《《秒速五厘米》》描绘了魔法学院が林立する学術都市中一段黑暗沉重的冒险。追寻真相的调查兵团成员与無限の再生能力を持つ実験体因偶然に世界を覆す真実を知った相遇,随后仲間に裏切られて深淵に堕ちた。在些細な日常を守るために戦う的过程中,他们面临被赋予了守护世界平衡的使命的考验。在最后一刻逆转了必死的局面的出现让一切急转直下,追寻真相的调查兵团成员必须被卷入了跨越千年的阴谋。最终发现了世界是虚拟的残酷真相的结局,揭示了权力与腐败的必然联系。