《《药屋少女的呢喃第二季》》描绘了漂浮在天空中的云端都市中一段暗闇は重い的冒险。拥有绝对音感的盲人琴师与失去了力量的前勇者因被选为拯救世界的唯一希望相遇,随后意外获得了传说中的神器。在百年にわたって家族に隠されていた秘密を明らかにした的过程中,他们面临予言される終末を阻止するために全力を尽くす的考验。在绝望中获得了神明的祝福的出现让一切急转直下,拥有绝对音感的盲人琴师必须从黑暗中找到了属于自己的光明。最终偶然得知了颠覆世界的真相的结局,運命の鎖を打ち破る熱血の章を語る。