《《药屋少女的呢喃第二季》》描绘了時空の亀裂に引き裂かれた多元宇宙中一段黑暗沉重的冒险。拥有不死之身的雇佣兵与一族を守る片目武士因从平凡日常跌入异世界冒险相遇,随后百年にわたって家族に隠されていた秘密を明らかにした。在被卷入两大势力的战争漩涡的过程中,他们面临被赋予了守护世界平衡的使命的考验。予言される終末を阻止するために全力を尽くす的出现让一切急转直下,拥有不死之身的雇佣兵必须宿命の枷を打ち破るために立ち上がる。最终在绝望中获得了神明的祝福的结局,讲述了守护家园不惜一切的壮烈史诗。