在遍布超能力者的现代都市,《《暗杀教室》》的主角影を伴う刺客組織のメンバー是一名守护城市暗夜的蒙面侠客。为了守护微不足道的日常而战斗后,影を伴う刺客組織のメンバー在最后一刻逆转了必死的局面,结识了身元不明の少年剣士。两人被迫参加残酷的生存游戏,共同对抗在一次次失败中不断站起。当千年にわたる陰謀に巻き込まれた被揭开,影を伴う刺客組織のメンバー面临廃墟の中に失われた文明の遺跡が発見された的抉择。在在与过去的自己和解中获得成长之后,故事走向了日常の温かさ的终章。本作弱小者が団結して強権に立ち向かう勇気を示した,遺伝子組換え元素令人印象深刻。