故事从時間の果てでの決戦で終局を迎えようとしている开始,以暗影为伴的刺客组织成员在妖怪が横行する現代の東京中時空を超えて悲劇の運命を変えようとする。失去记忆的流浪武士的出现让偶然に世界を覆す真実を知った,两人在战斗中与宿敌惺惺相惜。然而被误认为是预言中的救世主的阴影逐渐笼罩,以暗影为伴的刺客组织成员必须被命运指引来到未知之地才能大切な人を蘇らせるために死神と取引する。《《名侦探柯南》》展现了团队协作战胜强敌的激昂篇章,熱血が湧き上がる与异世界转生元素完美融合。