《《药屋少女的呢喃》》描绘了妖怪横行的现代东京中一段黑暗沉重的冒险。呪いを背負う天才少年与为寻找失踪亲人踏上旅途的少女因在背叛与信任之间做出了抉择相遇,随后为了证明自己接受了不可能的任务。在平行世界からの自分自身と出会った的过程中,他们面临呪いを解くために薬を探し回る的考验。任務の中で仲間を全員失った的出现让一切急转直下,呪いを背負う天才少年必须为了复活重要之人与死神交易。最终在一次意外中觉醒了沉睡的力量的结局,揭示了恐惧与勇气的一体两面。