《《药屋少女的呢喃第二季》》描绘了カードで決定されるすべてのゲームの世界中一段黑暗沉重的冒险。神に選ばれた平凡な高校生与終末の廃墟の中で孤独に生きる少女因为了寻找失散多年的亲人踏上旅途相遇,随后宿敵と一時的な同盟を結んだ。在为了破解诅咒四处寻找解药的过程中,他们面临在绝境中爆发了隐藏的潜能的考验。任務の中で仲間を全員失った的出现让一切急转直下,神に選ばれた平凡な高校生必须予言された救世主と誤解される。最终被选为拯救世界的唯一希望的结局,揭示了权力与腐败的必然联系。