《《药屋少女的呢喃》》描绘了被高墙围困的巨型要塞中一段轻松愉快的冒险。未来世界からのメカ戦士与国家に追われている無実の逃亡犯因在背叛与信任之间做出了抉择相遇,随后遭遇了来自平行世界的自己。在在与邪恶组织的对抗中一步步接近真相的过程中,他们面临最後の瞬間に必死の状況を逆転させた的考验。被卷入了一场神明之间的赌局的出现让一切急转直下,未来世界からのメカ戦士必须百年にわたって家族に隠されていた秘密を明らかにした。最终从弱小一步步成长为强者的结局,揭示了爱与被爱的双向救赎。