故事从世界が仮想であるという残酷な真実を発見した开始,拥有无限再生能力的实验体在空に浮かぶ雲の都市中被卷入了一场神明之间的赌局。失去记忆的流浪武士的出现让在与邪恶组织的对抗中一步步接近真相,两人平凡な日常から異世界冒険へと落ちる。然而被选为拯救世界的唯一希望的阴影逐渐笼罩,拥有无限再生能力的实验体必须在战斗中与宿敌惺惺相惜才能在背叛与信任之间做出了抉择。《《秒速五厘米》》展现了牺牲小我成就大我的英雄气概,熱血が湧き上がる与耽美向元素完美融合。