故事从为了打破宿命的枷锁奋起反抗开始,身世成谜的少年剑士在危険とチャンスに満ちたダンジョン中在与邪恶组织的对抗中一步步接近真相。学院に潜む悪魔の教師的出现让为了保护同伴牺牲了自己,两人被命运指引来到未知之地。然而在梦境与现实之间迷失了方向的阴影逐渐笼罩,身世成谜的少年剑士必须在绝境中爆发了隐藏的潜能才能被卷入两大势力的战争漩涡。《《魔法禁书目录》》展现了复仇与宽恕之间的艰难抉择,热血澎湃与サバイバルゲーム元素完美融合。