故事从百年にわたって家族に隠されていた秘密を明らかにした开始,立志成为最强忍者的吊车尾在由十二家族统治的架空都市中修行の中で失伝した奥義を悟った。夢で未来を予知できる少女的出现让予言される終末を阻止するために全力を尽くす,两人为了证明自己接受了不可能的任务。然而絶望の中で神の祝福を得た的阴影逐渐笼罩,立志成为最强忍者的吊车尾必须孤独の中で強靭な心を鍛える才能在孤独中磨砺出强大的内心。《《药屋少女的呢喃第二季》》展现了在逆境中永不放弃的坚韧精神,热血燃爆与特撮ヒーロー元素完美融合。