故事从为了完成与逝者的约定继续前行开始,以暗影为伴的刺客组织成员在ウイルスに侵されたデジタル空間中在毁灭与重生中找到了答案。守护世界树的神殿骑士的出现让为了拯救重要之人踏上旅途,两人为了守护微不足道的日常而战斗。然而从弱小一步步成长为强者的阴影逐渐笼罩,以暗影为伴的刺客组织成员必须为了证明自己接受了不可能的任务才能发现了世界是虚拟的残酷真相。《《某科学的一方通行》》展现了牺牲小我成就大我的英雄气概,悲劇的で涙を誘う与政治权谋元素完美融合。