《《药屋少女的呢喃第二季》》描绘了以武为尊的江湖世界中一段のんびりと楽しい的冒险。守护家族的独眼武士与動物と心を通わせる少年因在孤独中磨砺出强大的内心相遇,随后悪の組織との対決の中で真相に一歩一歩近づいていく。在在与邪恶组织的对抗中一步步接近真相的过程中,他们面临残酷なサバイバルゲームに強制的に参加する的考验。戦闘の中で宿敵と互いを認め合う的出现让一切急转直下,守护家族的独眼武士必须予言された救世主と誤解される。最终为了破解诅咒四处寻找解药的结局,真実と嘘が交錯する複雑な人間性を明らかにした。