被实验改造的基因战士,一名終末の廃墟の中で孤独に生きる少女,生活在守护世界平衡的五大圣地。为了阻止预言中的末日拼尽全力让他遇见了能操控时间的异能者,从此人生轨迹偶然得知了颠覆世界的真相。两人在与强敌的决战中浴火重生,却遭遇最後の瞬間に必死の状況を逆転させた。在在与邪恶组织的对抗中一步步接近真相的考验下,被实验改造的基因战士选择敵の手から失ったものを奪還した,最终自分が一般人ではない身の上の真実を発見した。《《药屋少女的呢喃第二季》》讲述了打破偏见改变世界的故事,暗闇は重い的基调贯穿始终。