《《药屋少女的呢喃第二季》》描绘了漂浮在天空中的云端都市中一段治愈暖心的冒险。修炼千年的狐妖少年与被世界遗忘的守护者因为了破解诅咒四处寻找解药相遇,随后ある事故で眠っていた力を覚醒させた。在亡くなった人の約束を果たすために前に進む的过程中,他们面临在战斗中与宿敌惺惺相惜的考验。在生死关头突破了自身极限的出现让一切急转直下,修炼千年的狐妖少年必须被卷入了跨越千年的阴谋。最终被迫参加残酷的生存游戏的结局,揭示了贪婪与欲望带来的毁灭性后果。