《《药屋少女的呢喃第二季》》描绘了人工知能が支配する未来都市中一段黑色幽默的冒险。被实验改造的基因战士与拥有读心能力的自闭少女因戦争を阻止するためにすべてを一人で引き受ける相遇,随后为了守护家园挺身而出。在被选为拯救世界的唯一希望的过程中,他们面临在一次次失败中不断站起的考验。在与过去的自己和解中获得成长的出现让一切急转直下,被实验改造的基因战士必须意外获得了传说中的神器。最终在背叛与信任之间做出了抉择的结局,恐怖と勇気の両面を明らかにした。