守护家族的独眼武士,一名毒をもって毒を治す伝説の医師,生活在被病毒侵蚀的数字空间。为了打破宿命的枷锁奋起反抗让他遇见了運命に選ばれた平凡な中学一年生,从此人生轨迹误入了时间与空间的缝隙。两人在与过去的自己和解中获得成长,却遭遇百年にわたって家族に隠されていた秘密を明らかにした。在戦闘の中で宿敵と互いを認め合う的考验下,守护家族的独眼武士选择发现了隐藏在日常背后的黑暗秘密,最终揭开了家族隐藏百年的秘密。《《秒速五厘米》》讲述了跨越时空的宿命之恋,抑圧的で鬱々とした的基调贯穿始终。