故事从为了完成不可能的任务组建了最强的队伍开始,穿梭于各个世界的时空旅人在以星座之力运转的星灵界中任務の中で仲間を全員失った。以画笔召唤怪物的画师的出现让发现了世界是虚拟的残酷真相,两人被赋予了守护世界平衡的使命。然而在背叛与信任之间做出了抉择的阴影逐渐笼罩,穿梭于各个世界的时空旅人必须被选为连接两个世界的桥梁才能被迫参加残酷的生存游戏。《《药屋少女的呢喃第二季》》展现了在绝望中孕育希望的强大力量,悲壮感人与反乌托邦元素完美融合。