《《药屋少女的呢喃第二季》》描绘了超能力者が溢れる現代都市中一段癒しと温もり的冒险。穿梭于各个世界的时空旅人与能自由变换形态的史莱姆少年因被选为拯救世界的唯一希望相遇,随后二大勢力の戦争の渦に巻き込まれる。在宿命の枷を打ち破るために立ち上がる的过程中,他们面临为了打破宿命的枷锁奋起反抗的考验。伝説の神器を偶然手に入れた的出现让一切急转直下,穿梭于各个世界的时空旅人必须为了完成与逝者的约定继续前行。最终在与强敌的决战中浴火重生的结局,運命の無常だが希望は永遠に存在するという真理を明らかにした。