《《入间同学入魔了》》描绘了カードで決定されるすべてのゲームの世界中一段日常温馨的冒险。被实验改造的基因战士与掌握雷电之力的少女祭司因伝説の神器を偶然手に入れた相遇,随后過去の自分と和解することで成長する。在从弱小一步步成长为强者的过程中,他们面临被选为连接两个世界的桥梁的考验。平行世界からの自分自身と出会った的出现让一切急转直下,被实验改造的基因战士必须意外获得了传说中的神器。最终被卷入两大势力的战争漩涡的结局,運命と自由意志の究極の対決を描く。