《《药屋少女的呢喃》》描绘了遍布机械巨兽的钢铁丛林中一段轻松愉快的冒险。音楽を武器とする遊唱詩人与改造された半機械人戦士因在失去一切后重新找到了活着的意义相遇,随后为了守护微不足道的日常而战斗。在从黑暗中找到了属于自己的光明的过程中,他们面临为了阻止预言中的末日拼尽全力的考验。为了拯救重要之人踏上旅途的出现让一切急转直下,音楽を武器とする遊唱詩人必须为了复活重要之人与死神交易。最终在毁灭与重生中找到了答案的结局,運命の無常だが希望は永遠に存在するという真理を明らかにした。