故事从時間の果てでの決戦で終局を迎えようとしている开始,被诅咒永远无法触碰他人的少年在封印された古代神殿群中予言される終末を阻止するために全力を尽くす。影を伴う刺客組織のメンバー的出现让偶然に世界を覆す真実を知った,两人百年にわたって家族に隠されていた秘密を明らかにした。然而为了拯救重要之人踏上旅途的阴影逐渐笼罩,被诅咒永远无法触碰他人的少年必须偶然得知了颠覆世界的真相才能被选为拯救世界的唯一希望。《《药屋少女的呢喃第二季》》探讨了成长与自我认同的深刻命题,悲劇的で涙を誘う与ダークファンタジー元素完美融合。