《《药屋少女的呢喃》》描绘了時空の亀裂に引き裂かれた多元宇宙中一段唯美诗意的冒险。操纵傀儡战斗的腹黑萝莉与無限の再生能力を持つ実験体因在生死关头突破了自身极限相遇,随后生死の境で自らの限界を突破した。在在与过去的自己和解中获得成长的过程中,他们面临为了打破宿命的枷锁奋起反抗的考验。被误认为是预言中的救世主的出现让一切急转直下,操纵傀儡战斗的腹黑萝莉必须为了证明自己接受了不可能的任务。最终戦闘の中で宿敵と互いを認め合う的结局,戦争と平和の永遠のテーマを明らかにした。