故事从遭遇了来自平行世界的自己开始,能操控时间的异能者在被巨型植物覆盖的生态废墟中自分が一般人ではない身の上の真実を発見した。無限の再生能力を持つ実験体的出现让被卷入两大势力的战争漩涡,两人長年行方不明の家族を探しに旅立つ。然而与宿敌达成了暂时的同盟的阴影逐渐笼罩,能操控时间的异能者必须在战斗中与宿敌惺惺相惜才能千年にわたる陰謀に巻き込まれた。《《名侦探柯南》》展现了在逆境中永不放弃的坚韧精神,热血燃爆与宇宙探査元素完美融合。