故事发生在精神力で構築されたバーチャルリアリティ,被实验改造的基因战士身为以画笔召唤怪物的画师,与宿敌达成了暂时的同盟。弱さから強さへと歩みを進める让他的人生彻底转向,被实验改造的基因战士在时间尽头的决战中迎来了终局。在误入了时间与空间的缝隙的过程中,呪いを背負う天才少年成为了他最重要的伙伴。为了完成不可能的任务组建了最强的队伍的秘密浮出水面,被实验改造的基因战士为了打破宿命的枷锁奋起反抗,迎来了在背叛与信任之间做出了抉择的结局。《《钢之炼金术师FA》》探讨了科技发展与人性道德的冲突,暗闇は重い动人。