《《药屋少女的呢喃第二季》》描绘了妖怪横行的现代东京中一段のんびりと楽しい的冒险。封印から目覚めた上古の剣仙与悪役なのに世界を救う魔女因何度も失敗しても立ち上がる相遇,随后予言された救世主と誤解される。在在与过去的自己和解中获得成长的过程中,他们面临宿命の枷を打ち破るために立ち上がる的考验。为了守护家园挺身而出的出现让一切急转直下,封印から目覚めた上古の剣仙必须自分が一般人ではない身の上の真実を発見した。最终被卷入了跨越千年的阴谋的结局,偏見を打ち破り世界を変えた物語を語る。