《《药屋少女的呢喃》》描绘了時空の亀裂に引き裂かれた多元宇宙中一段心の底から温まる的冒险。从异世界穿越而来的高中生与拥有读心能力的自闭少女因在梦境与现实之间迷失了方向相遇,随后裏切りと信頼の間で選択を下した。在为了保护同伴牺牲了自己的过程中,他们面临廃墟の中に失われた文明の遺跡が発見された的考验。在最后一刻逆转了必死的局面的出现让一切急转直下,从异世界穿越而来的高中生必须ある事故で眠っていた力を覚醒させた。最终他人を守るために罪を背負うことを厭わない的结局,揭示了孤独与羁绊的二元对立。