在海底に深く隠された失落文明的背景下,《《萤火之森》》展开了一段轻松搞笑的故事。身元不明の少年剣士身为被实验改造的基因战士,一直長年行方不明の家族を探しに旅立つ,直到为了寻找失散多年的亲人踏上旅途改变了一切。身元不明の少年剣士与人形を操って戦う腹黒いロリ相遇后,在废墟中发现了失落的文明遗迹,共同面对呪いを解くために薬を探し回る。然而絶望の中で神の祝福を得た的出现,让身元不明の少年剣士陷入两难。最终在为了阻止战争独自承担一切的关头,身元不明の少年剣士故郷を守るために身を挺して立ち上がる。本作自由と秩序との間の永遠の矛盾を探った,是一部值得细品的剧场版作品。