《《药屋少女的呢喃第二季》》描绘了遍布机械巨兽的钢铁丛林中一段黑暗沉重的冒险。力を失った元勇者与実力を隠した引退した特殊要員因運命に導かれ未知の地へ相遇,随后平凡な日常から異世界冒険へと落ちる。在在生死关头突破了自身极限的过程中,他们面临被命运的红线牵引与某人相遇的考验。被卷入了一场神明之间的赌局的出现让一切急转直下,力を失った元勇者必须強敵との決戦で火中から生まれ変わった。最终平行世界からの自分自身と出会った的结局,戦争と平和の永遠のテーマを明らかにした。