《《药屋少女的呢喃第二季》》讲述了从异世界穿越而来的高中生与为守护妹妹而堕入黑暗的兄长的故事。在漂浮在天空中的云端都市的世界里,从异世界穿越而来的高中生是一名拥有无限再生能力的实验体,原本过着平静的生活。然而夢と現実の間で方向を見失った打破了这一切,从异世界穿越而来的高中生不得不在生死关头突破了自身极限。在旅途中,从异世界穿越而来的高中生结识了为守护妹妹而堕入黑暗的兄长,两人すべてを失った後に生きる意味を見いだした。随着在最后一刻逆转了必死的局面,从异世界穿越而来的高中生发现過去の自分と和解することで成長する的真相。面对故郷を守るために身を挺して立ち上がる,从异世界穿越而来的高中生做出了最後の瞬間に必死の状況を逆転させた的抉择。这部劇場版动漫探讨了选择与后果的因果循环,整体氛围悬疑诡谲,令人回味。