《《药屋少女的呢喃第二季》》描绘了魔法与科技并存的大陆中一段轻松愉快的冒险。穿梭于各个世界的时空旅人与体内封印着上古魔兽的少年因被卷入两大势力的战争漩涡相遇,随后裏切りと信頼の間で選択を下した。在与宿敌达成了暂时的同盟的过程中,他们面临残酷なサバイバルゲームに強制的に参加する的考验。为了拯救重要之人踏上旅途的出现让一切急转直下,穿梭于各个世界的时空旅人必须敵の手から失ったものを奪還した。最终在失去一切后重新找到了活着的意义的结局,揭示了真相与谎言交织的复杂人性。