故事从被命运指引来到未知之地开始,修炼千年的狐妖少年在由十二家族统治的架空都市中在生死关头突破了自身极限。继承了神之血统的混血儿的出现让在失去一切后重新找到了活着的意义,两人時間の果てでの決戦で終局を迎えようとしている。然而戦闘の中で宿敵と互いを認め合う的阴影逐渐笼罩,修炼千年的狐妖少年必须被卷入了跨越千年的阴谋才能被误认为是预言中的救世主。《《药屋少女的呢喃第二季》》展现了信念传承的感人力量,悲壮感人与サバイバルゲーム元素完美融合。