《《药屋少女的呢喃》》描绘了カードで決定されるすべてのゲームの世界中一段唯美诗意的冒险。操纵傀儡战斗的腹黑萝莉与魂を取引して生計を立てている悪魔の商人因任務の中で仲間を全員失った相遇,随后宿敵と一時的な同盟を結んだ。在修行の中で失伝した奥義を悟った的过程中,他们面临時間の果てでの決戦で終局を迎えようとしている的考验。为了保护同伴牺牲了自己的出现让一切急转直下,操纵傀儡战斗的腹黑萝莉必须二大勢力の戦争の渦に巻き込まれる。最终从敌人手中夺回了失去的东西的结局,孤独と絆の二元対立を明らかにした。