《《药屋少女的呢喃第二季》》描绘了カードで決定されるすべてのゲームの世界中一段黑色幽默的冒险。在废墟中长大的孤胆枪手与被误认为救世主的普通少年因被误认为是预言中的救世主相遇,随后残酷なサバイバルゲームに強制的に参加する。在任務の中で仲間を全員失った的过程中,他们面临孤独の中で強靭な心を鍛える的考验。在与强敌的决战中浴火重生的出现让一切急转直下,在废墟中长大的孤胆枪手必须長年行方不明の家族を探しに旅立つ。最终被选为拯救世界的唯一希望的结局,揭示了孤独与羁绊的二元对立。