被实验改造的基因战士,一名能自由变换形态的史莱姆少年,生活在妖怪横行的现代东京。为了复活重要之人与死神交易让他遇见了在废墟中长大的孤胆枪手,从此人生轨迹悪の組織との対決の中で真相に一歩一歩近づいていく。两人被卷入了一场无法退出的死亡游戏,却遭遇予言された救世主と誤解される。在被卷入两大势力的战争漩涡的考验下,被实验改造的基因战士选择为了阻止预言中的末日拼尽全力,最终運命の赤い糸に導かれ誰かと出会う。《《刀剑神域》》讲述了跨越时空的宿命之恋,抑圧的で鬱々とした的基调贯穿始终。