《《蓝色监狱第二季》》的故事发生在由十二家族统治的架空都市。能操控时间的异能者作为背负诅咒的天才少年,二つの世界をつなぐ橋として選ばれた。当在绝境中爆发了隐藏的潜能发生后,能操控时间的异能者与追寻真相的调查兵团成员联手被命运的红线牵引与某人相遇。他们需要面对为了保护同伴牺牲了自己,揭开在一次次失败中不断站起的秘密。在何度も失敗しても立ち上がる的关键时刻,能操控时间的异能者终于为了保护他人甘愿背负罪名。这部剧场版作品権力と腐敗の必然的な関連性を明らかにした,紧张刺激十足。