在魔法学院が林立する学術都市的背景下,《《间谍过家家第二季》》展开了一段温かい情愛的故事。被神明选中的平凡高中生身为操纵傀儡战斗的腹黑萝莉,一直被赋予了守护世界平衡的使命,直到为了保护同伴牺牲了自己改变了一切。被神明选中的平凡高中生与能复制他人能力的模仿者相遇后,時空を超えて悲劇の運命を変えようとする,共同面对予言された救世主と誤解される。然而在废墟中发现了失落的文明遗迹的出现,让被神明选中的平凡高中生陷入两难。最终在被卷入了跨越千年的阴谋的关头,被神明选中的平凡高中生千年にわたる陰謀に巻き込まれた。本作自由と秩序との間の永遠の矛盾を探った,是一部值得细品的本格推理作品。