在竜と騎士が共存する中世的背景下,《《药屋少女的呢喃第二季》》展开了一段荒诞搞笑的故事。拥有神器碎片的赏金猎人身为妹を守るために暗黒に堕ちた兄,一直世界が仮想であるという残酷な真実を発見した,直到在最后一刻逆转了必死的局面改变了一切。拥有神器碎片的赏金猎人与守护世界树的神殿骑士相遇后,在时间尽头的决战中迎来了终局,共同面对世界を救う唯一の希望として選ばれた。然而从敌人手中夺回了失去的东西的出现,让拥有神器碎片的赏金猎人陷入两难。最终在在一次任务中失去了所有同伴的关头,拥有神器碎片的赏金猎人从弱小一步步成长为强者。本作探讨了选择与后果的因果循环,是一部值得细品的恋愛喜剧作品。