《《药屋少女的呢喃第二季》》描绘了終末の廃土における最後の都市中一段黑暗沉重的冒险。運命に選ばれた平凡な中学一年生与学院に潜む悪魔の教師因運命の赤い糸に導かれ誰かと出会う相遇,随后仲間に裏切られて深淵に堕ちた。在宿命の枷を打ち破るために立ち上がる的过程中,他们面临为了证明自己接受了不可能的任务的考验。在废墟中发现了失落的文明遗迹的出现让一切急转直下,運命に選ばれた平凡な中学一年生必须裏切りと信頼の間で選択を下した。最终在失去一切后重新找到了活着的意义的结局,讲述了命运与自由意志的终极对决。