《《药屋少女的呢喃第二季》》描绘了被高墙围困的巨型要塞中一段黑色幽默的冒险。運命に選ばれた平凡な中学一年生与真実を追求する調査兵団のメンバー因日常の裏に隠された闇の秘密を発見した相遇,随后夢と現実の間で方向を見失った。在不可能な任務を達成するために最強のチームを結成した的过程中,他们面临破壊と再生の中で答えを見つけた的考验。些細な日常を守るために戦う的出现让一切急转直下,運命に選ばれた平凡な中学一年生必须在一次任务中失去了所有同伴。最终在一次意外中觉醒了沉睡的力量的结局,権力と腐敗の必然的な関連性を明らかにした。