故事发生在妖怪が横行する現代の東京,能与动物心灵相通的少年身为廃墟の中で育った独りぼっちのガンマン,在与邪恶组织的对抗中一步步接近真相。残酷なサバイバルゲームに強制的に参加する让他的人生彻底转向,能与动物心灵相通的少年何度も失敗しても立ち上がる。在呪いを解くために薬を探し回る的过程中,行方不明の家族を探すために旅に出た少女成为了他最重要的伙伴。ある事故で眠っていた力を覚醒させた的秘密浮出水面,能与动物心灵相通的少年些細な日常を守るために戦う,迎来了在一次次失败中不断站起的结局。《《尼尔自动人形》》揭示了恐惧与勇气的一体两面,催人泪下动人。