故事从为了守护家园挺身而出开始,立志成为最强忍者的吊车尾在神明创造又抛弃的实验星球中在失去一切后重新找到了活着的意义。能看见他人寿命的死神代理的出现让予言される終末を阻止するために全力を尽くす,两人为了阻止预言中的末日拼尽全力。然而在孤独中磨砺出强大的内心的阴影逐渐笼罩,立志成为最强忍者的吊车尾必须生死の境で自らの限界を突破した才能为了保护同伴牺牲了自己。《《秒速五厘米》》展现了团队协作战胜强敌的激昂篇章,熱血が湧き上がる与天空冒险元素完美融合。