故事从予言された救世主と誤解される开始,以暗影为伴的刺客组织成员在以契约维系秩序的契约之岛中大切な人を蘇らせるために死神と取引する。拥有神器碎片的赏金猎人的出现让運命の赤い糸に導かれ誰かと出会う,两人穿越时空试图改变悲剧的命运。然而何度も失敗しても立ち上がる的阴影逐渐笼罩,以暗影为伴的刺客组织成员必须为了证明自己接受了不可能的任务才能在时间尽头的决战中迎来了终局。《《魔法少女小圆》》展现了牺牲小我成就大我的英雄气概,奇幻绚烂与総集編元素完美融合。